Greek » Εργαστήριο » Ερευνητική Εργαστηριακή Υποδομή

Ερευνητική Εργαστηριακή Υποδομή

Το Εργαστήριο είναι οργανωμένο σύμφωνα με τα Διεθνή Πρότυπα εργαστηρίων Μοριακής Διαγνωστικής, έχει διαπιστευθεί από τον ΕΣΥΔ και έχει λάβει πιστοποιητικό ISO 15189 για την εκτέλεση των ακόλουθων αναλύσεων υγρής βιοψίας: α) Καταμέτρηση κυκλοφορούντων καρκινικών κυττάρων (CTCs) με το σύστημα CellSearch (εγκεκριμένο από τον FDA), β) Ανίχνευση μεταλλάξεων του EGFR στο πλάσμα ασθενών με μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), με την εφαρμογή του COBAS test (Roche, IVD test, εγκεκριμένο από τον FDA) και γ) Ανίχνευση της σχετικής έκφρασης του PD-L1 mRNA σε CTCs (Oncolipsy PD-L1 kit, CE-IVD, Pharmassist Ltd).

Διαφορετικοί χώροι με όλο τον απαραίτητο εξοπλισμό χρησιμοποιούνται για συγκεκριμένες διαδικασίες: α) απομόνωση CTCs και ctDNA από δείγματα περιφερικού αίματος, β) ειδικός χώρος για προετοιμασία αντιδράσεων PCR, γ) ειδικός χώρος για εκτέλεση αντιδράσεων PCR, δ) ειδικός χώρος για ανάλυση των δειγμάτων μετά την αντίδραση PCR.

Το εργαστήριο διαθέτει σε μεγάλο βαθμό την απαραίτητη υλικοτεχνική υποδομή για να αποτελεί κέντρο αναλύσεων υγρής βιοψίας. Συγκεκριμένα διαθέτει:

  • 1 σύστημα CellSearch® (Menarini Silicon Biosystems)
  • 1 συσκευή real-time PCR Cobas z4800 (IVD), με δυνατότητα ταυτόχρονης ανάλυσης 96 δειγμάτων (Roche Diagnostics)
  • 2 συσκευές Droplet Digital PCR (QX200™ & QX-600™ Droplet Digital™ PCR System, Biorad)
  • 2 συσκευές real-time PCR: LightCycler 2.0, LightCycler 1.5 (IVD όργανο), με δυνατότητα ταυτόχρονης ανάλυσης 32 δειγμάτων (Roche Diagnostics)
  • 2 συσκευές High Resolution melting (HRMA) analysis: High Resolution Melting Analysis, HR-1  και LightScanner32 με δυνατότητα ταυτόχρονης ανάλυσης 32 δειγμάτων (Idaho Technology)
  • 3 συσκευές κλασσικής PCR: 2 Mastercycler ep (Eppendorf) και 1 DNA Engine (MJ Research Inc., USA)
  • 1 Luminex® 200 (Luminex, xMAP® technologies)
  • 1 Qubit 4 fluorometer (Thermofisher)
  • 1 Nanodrop-1000 Φασματοφωτόμετρο (NanoDrop Technologies, USA)
  • Ειδικά και καινοτόμα συστήματα για την απομόνωση των CTC: Parsortix (Angle), ISET (Rare cells), GENESIS (Biorad)
  • Γενική εργαστηριακή υποδομή: 4 καταψύκτες (-20οC), 4 υπερκαταψύκτες (-70oC), ψυγεία (4oC), φυγόκεντροι, σύστημα φωτογράφισης πηκτών, θαλάμους προετοιμασίας αντιδράσεων PCR (PCR hoods), laminar flows κλπ.
Σύστημα CellSearch (Menarini Silicon Biosystems)
Parsortix (ANGLE)
QX-600 ddPCR (BIORAD)
Genesis (BIORAD)
Θάλαμος απομόνωσης RNA
Θάλαμος απομόνωσης DNA
Χώρος προετοιμασίας PCR και σύνθεσης cDNA
Θάλαμος προετοιμασίας PCR
DNA Engine (MJ Research Inc.)
Mastercycler ep (Eppendorf)
Σύστημα ηλεκτροφόρησης
Gel documentation system Infinity 115 (Vilber Lourmat)
LightCycler 1.5 (Roche)
LightCycler 2.0 (Roche)
Cobas z 480 Analyzer (Roche)
Luminex 200
LightScanner32 (Idaho Technology)
High Resolution Melting Analysis, HR-1 (Idaho Technology)
Nanodrop-1000 Spectrophotometer
Thermal Cycler C1000 Touch (BIORAD)
Automated microscope